現在、博物学は学問分野としては残っていないが、自然科学研究のひとつの方法として博物学的研究というのがある。博物学的研究は、理論的側面に弱いので、学問の世界では一段低く見られている傾向もある。しかし、自然科学の研究対象となる種々の自然物の記載分類は科学の基礎として欠かすことのできない作業であり、この部分が充実していないと研究材料の特定が困難となり、自然科学の諸分野は砂上の楼閣と化してしまう。そのため、博物学的研究の重要性はいまも変わっていない。
博物学的研究とは、野や山に向かい、動物・植物・鉱物などを収集・同定・分類する研究である。たとえば、牧野富太郎が行った植物研究や、南方熊楠が行った変形菌研究などがその例となる。
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またこの分野ではアマチュアの活動も大きい役割を担っている。たとえば昆虫などは、各地の昆虫採集好きのアマチュアが新種を発見することも多い。あるいは、野生生物の不思議な特徴や珍しい行動がアマチュアによって発見され、新たな発展が行われた例もある。ヨーロッパでは、博物学的研究の趣味が伝統的にあって、それを楽しむ人は「ナチュラリスト」と呼ばれている。
現在でも、製薬会社はプラントハンターたちを世界各国の特に熱帯雨林などの詳しい調査がこれまで行われていなかった地域に派遣して植物の収集に努めている。鉱物の分野でも、毎年数十の新種が新しく発見されている。
天体物理学が主流を占めている今日の天文学の分野でも、小惑星や彗星、新星の発見、分類は、未だ盛んであり、天文学におけるこの種の分野は、博物学の範疇であるとも言える。